Trods klare forbedringer i det seneste årti er Mali fortsat blandt de mest farlige steder på jorden for et
spædbarn eller et barn under 5 år. Næsten ét barn ud af fire vil dø, før de fylder fem år. En ud af tre lider af kronisk fejlernæring.
Billedet er typisk for Vestafrikas Sahel-region som helhed, og afspejler Malis sørgelige sundhedssystem. I
slutningen af 1990'erne havde kun 30 procent af befolkningen adgang til elementære sundhedsydelser og knap halvdelen havde adgang til rent vand. I Afrika, var det kun Benin og Den
Demokratiske Republik Congo der var værre på det tidspunkt. Disse statistikker var selvfølgelig betydeligt værre i 1980'erne.
Selv om tallene stadig er blandt verdens grimmeste, har der været nogle gevinster. En succes i 1990'erne var den fuldstændige afskaffelse af polio. Forekomsten blandt spædbørn har altid været høj i Mali, men eksploderede i 1970'erne og 1980'erne. Lanceringen af en omfattende vaccinationskampagne i 1988 fik effektive følger, og det sidste tilfælde af polio
blev registreret i 1995. Der har også været andre fremskridt. Guinea-ormen er effektivt udryddet. Gul feber er fraværende i øjeblikket, og det kræves, at man er vaccineret for dette før adgang i landet. Hansen's sygdom (spedalskhed) er i stigende grad en saga blot og flodblindhed siges at være i stærk tilbagegang. De værste mordere - malaria og dysenteri - forbliver dog udbredt, men Ikke
desto mindre kan den forventede levetid ved fødslen nu være så høj som
55 år, steget fra 46 år i 1990, ifølge FN's udviklingsprogram.